A biomassa ou massa orgânica representa a quantidade de matéria orgânica nos ecossistemas ou em cada nível trófico . é importante conhecer a biomassa e cada nível trófico , a fim de saber a quantidade de matéria e de energia disponível em cada nível e avaliar a eficiência nas transferências de um nível para outro. A biomassa é expressa em termos de quantidade de matéria orgânica por unidade de área ou volume em um dado momento. Essa quantidade de matéria orgânica pode ser obtida a partir do peso úmido , do peso seco ( a matéria orgânica é colocada em estufa para secar , até atingir peso constante ), do peso em carbono ( a matéria orgânica é colocada em mufla - uma estufa com revestimento refratário -, restando apenas as cinzas que correspondem aos minerais não -orgânicos), ou , ainda , de calorias. Supondo um campo rico em gramíneas ,pode-se determinar a biomassa desses produtores do seguinte modo: colhe-se toda a vegetação em uma área conhecida e coloca-se a vegetação em estufa, para obter o peso seco. O peso seco por unidade de área representa a biomassa do campo , que pode ser expressa em gramas mg2 ou em kg/m2. A forma da pirâmide de biomassa também pode variar , dependendo do ecossistema. De modo geral , a biomassa dos produtores é maior que a de herbívoros , que é maior que a dos carnívoros. Nesses casos, a pirâmide apresenta o ápice voltado para cima. Isso ocorre nos ecossistemas terrestres , onde , em geral , os produtores tem grande e ciclos de vida longos. A pirâmide de biomassa pode apresentar-se invertida, como ocorre nos oceanos e nos lagos. Nesses casos, a pirâmide apresenta o ápice voltado para cima. Isso ocorre nos ecossistemas terrestres, onde , em geral , os produtores têm grande porte e ciclos de vida longos. A pirâmide de biomassa pode apresentar-se invertida , como ocorre nos oceanos e nos lagos . Nesses casos, os produtores são representados por algas microscópicos com ciclo de vida curto, e de aproveitamento rápido pelo zooplâncton. A pirâmide é então , invertida entre esses níveis tróficos. Uma pirâmide com essa forma pode dar a fala impressão de que uma biomassa pequena suporta uma biomassa grande de consumidores primários. Deve-se lembrar , entretanto , que a medida de biomassa é feita para um determinado instante e que devido à alta taxa de reprodução do fitoplâncton em relação á do zooplâncton, e devido ao rápido aproveitamento do fitoplâncton pelo zooplâncton , obtém-se uma biomassa de produtores aparentemente menor que a de consumidores de primeira ordem. Apesar e a pirâmide de biomassa expressar melhor que a pirâmide de números a transferência de matéria em um ecossistema , ela apresenta dois inconvenientes básicos:
1ª- atribui a mesma importância a diferentes tipos de tecidos dos vegetais e dos animais. Como há tecidos com composição química diferente, cada um deles tem diferentes valores energéticos. Por exemplo: tecido rios em carboidratos têm maior conteúdo energético que tecidos ricos em proteínas.
2ª- não leva em consideração o fator tempo. A biomassa é uma medida obtida para um dado instante , não levando em consideração o tempo que um organismo leva para acumular aquela matéria orgânica. O fitoplâncton , por exemplo , acumula em alguns dias e uma árvore demora vários anos.
Assim, se as pirâmides de biomassa invertidas fossem construídas levando-se em consideração esses fatores , elas apresentariam o ápice voltado para cima. Por isso, uma das melhores maneiras de expressar graficamente a transferência de matéria e de energia é a pirâmide de energia.